先说结论：在支持电子保函的交易平台上，电子保函与纸质保函具有同等法律效力，招标方应当接受。

差别主要在三点：

1. 出函速度：电子保函线上申请、系统自动核验，一般当天出；纸质保函涉及打印、寄送或自取，通常要 1—3 个工作日。

2. 核验方式：电子保函由招标方在平台在线核验真伪，假保函基本没有生存空间；纸质保函靠电话或线下核实，流程慢。

3. 保管流转：电子保函不怕丢、不怕忘带，开标前下载提交即可；纸质保函丢了补办很麻烦。

目前四川省内多数市州的交易中心已支持电子保函，具体项目以招标文件和平台公告为准。